76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1663 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  100 
 
 
600 aa  1205    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  29.26 
 
 
587 aa  210  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  31.66 
 
 
946 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  29.04 
 
 
949 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  27.59 
 
 
833 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.89 
 
 
778 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.5 
 
 
938 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  30.3 
 
 
1093 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  25.75 
 
 
957 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.98 
 
 
824 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  26.91 
 
 
939 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  28.63 
 
 
973 aa  142  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  31.45 
 
 
1133 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  31.45 
 
 
1139 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  25.47 
 
 
953 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.81 
 
 
921 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  30.9 
 
 
1146 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  27.95 
 
 
902 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  27.7 
 
 
1198 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  30.43 
 
 
1155 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
1130 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
1124 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  28.84 
 
 
1133 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  28.61 
 
 
903 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  28.22 
 
 
1201 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  30.06 
 
 
989 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  29.24 
 
 
941 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  24.81 
 
 
1200 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  27.12 
 
 
1128 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  26.9 
 
 
823 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  26.5 
 
 
1242 aa  97.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  23.33 
 
 
850 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.67 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.74 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.67 
 
 
573 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.67 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  23.15 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  23.49 
 
 
573 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  25.53 
 
 
1207 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.97 
 
 
573 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.59 
 
 
573 aa  90.9  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.2 
 
 
1312 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  28.57 
 
 
774 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.64 
 
 
573 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  32.93 
 
 
891 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  24.85 
 
 
573 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  23.46 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  25 
 
 
884 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  23.81 
 
 
847 aa  63.9  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  22.66 
 
 
906 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  28.05 
 
 
856 aa  57.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  29.03 
 
 
1064 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  27.34 
 
 
1048 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  25.44 
 
 
893 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  27.78 
 
 
1063 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  23.62 
 
 
899 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  26.61 
 
 
1048 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  26.56 
 
 
1065 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  26.56 
 
 
1045 aa  51.6  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  26.56 
 
 
1070 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  26.56 
 
 
1070 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  26.56 
 
 
1048 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  20.7 
 
 
934 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  31.78 
 
 
1045 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  26.61 
 
 
616 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  25.81 
 
 
1013 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  36 
 
 
954 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  30 
 
 
920 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  36 
 
 
954 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  20.36 
 
 
939 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  24.18 
 
 
926 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  21.63 
 
 
1019 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  36 
 
 
901 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  30.19 
 
 
449 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  36.49 
 
 
910 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 
894 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>