52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2282 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  100 
 
 		 1045 aa  2071    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  31.52 
 
 		 957 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  30.99 
 
 		 953 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  29.52 
 
 		 949 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  30.32 
 
 		 938 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  27.72 
 
 		 1093 aa  188  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  29.12 
 
 		 973 aa  187  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1201 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 939 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  31.04 
 
 		 1139 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  30.81 
 
 		 1133 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1200 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  28.82 
 
 		 1130 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  28.82 
 
 		 1155 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  28.82 
 
 		 1124 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  29.2 
 
 		 1146 aa  171  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  28.12 
 
 		 946 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  29.19 
 
 		 902 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  31.1 
 
 		 1133 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1198 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  31.91 
 
 		 1207 aa  157  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 989 aa  156  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  27.75 
 
 		 903 aa  155  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1128 aa  148  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  31.44 
 
 		 941 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  30.05 
 
 		 891 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  30.68 
 
 		 774 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1242 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  23.22 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.43 
 
 		 833 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.51 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1981  hypothetical protein  81.97 
 
 		 80 aa  77  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.342357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  25.08 
 
 		 1312 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  20.82 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.74 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.66 
 
 		 850 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  26.15 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  23.69 
 
 		 856 aa  62.4  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  29.41 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  22.41 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.12 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  24.71 
 
 		 906 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  21 
 
 		 934 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1048 aa  48.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  20.23 
 
 		 573 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  20.23 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  20.23 
 
 		 573 aa  45.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  20.23 
 
 		 573 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  20.23 
 
 		 573 aa  45.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.26 
 
 		 573 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1048 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>