52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1537 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  78.84 
 
 		 1128 aa  1592    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 1242 aa  2353    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1200 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1198 aa  529  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  41.53 
 
 		 1201 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  47.49 
 
 		 939 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  43.63 
 
 		 1207 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  39.52 
 
 		 957 aa  311  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  37.72 
 
 		 949 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  38.62 
 
 		 938 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  39.56 
 
 		 953 aa  290  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  41.2 
 
 		 1093 aa  279  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 902 aa  266  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  43.36 
 
 		 1133 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  42.96 
 
 		 1139 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  40.24 
 
 		 903 aa  265  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  36.51 
 
 		 973 aa  263  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  34 
 
 		 1146 aa  258  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  42.82 
 
 		 1133 aa  246  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  43.24 
 
 		 1155 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  38.59 
 
 		 1124 aa  244  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  38.59 
 
 		 1130 aa  244  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  35.68 
 
 		 946 aa  240  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  41.99 
 
 		 989 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  41.85 
 
 		 891 aa  222  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  40.36 
 
 		 941 aa  211  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  42.57 
 
 		 774 aa  204  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  27.48 
 
 		 1045 aa  126  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  26.76 
 
 		 833 aa  121  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  25.91 
 
 		 778 aa  121  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.3 
 
 		 587 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.75 
 
 		 600 aa  112  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.88 
 
 		 824 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 1312 aa  103  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  21.87 
 
 		 823 aa  97.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.7 
 
 		 921 aa  84  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.37 
 
 		 934 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  32.21 
 
 		 915 aa  53.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  32.16 
 
 		 893 aa  53.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  24.19 
 
 		 906 aa  52.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  23.22 
 
 		 954 aa  52  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  23.22 
 
 		 954 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  21.29 
 
 		 573 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  33.13 
 
 		 920 aa  51.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  32.82 
 
 		 915 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  29.84 
 
 		 331 aa  49.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  35.67 
 
 		 894 aa  48.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  20.08 
 
 		 573 aa  47.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  21.29 
 
 		 573 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  30.22 
 
 		 899 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  24 
 
 		 939 aa  46.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>