70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2493 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  100 
 
 		 921 aa  1842    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  24.16 
 
 		 824 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  27.21 
 
 		 833 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  26.35 
 
 		 778 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  27.81 
 
 		 600 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  26.47 
 
 		 949 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1201 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  26.98 
 
 		 902 aa  101  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1200 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  26.82 
 
 		 587 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.85 
 
 		 1093 aa  95.5  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  25.29 
 
 		 957 aa  95.1  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  27.75 
 
 		 953 aa  92  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  25.44 
 
 		 973 aa  90.9  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1198 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  25.42 
 
 		 939 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  27.15 
 
 		 823 aa  89  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.86 
 
 		 954 aa  88.6  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  25.61 
 
 		 938 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  30.53 
 
 		 954 aa  86.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  26.1 
 
 		 1312 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1128 aa  85.5  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.33 
 
 		 934 aa  84.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  28.18 
 
 		 1133 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  28.18 
 
 		 1139 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 		 903 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  27.93 
 
 		 891 aa  79.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  21.72 
 
 		 946 aa  75.5  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  27.3 
 
 		 1207 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1242 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  26.69 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1064 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  26.25 
 
 		 1146 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1048 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1070 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1063 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1070 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  24.01 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  27.57 
 
 		 847 aa  65.1  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1065 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.05 
 
 		 573 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1048 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0607  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1278 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.591386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1045 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  20.66 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  20.9 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.17 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  21.82 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.17 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.17 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  25 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  25 
 
 		 1155 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  20.24 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  21.72 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  25 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  22.31 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  23.49 
 
 		 906 aa  57.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  29.22 
 
 		 915 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  21.7 
 
 		 573 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  24.35 
 
 		 939 aa  57  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  28.16 
 
 		 915 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  25.43 
 
 		 941 aa  51.6  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  33.9 
 
 		 926 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  21.33 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  25.13 
 
 		 856 aa  48.5  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  24.72 
 
 		 989 aa  47.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  26.55 
 
 		 893 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0635  hypothetical protein  24.51 
 
 		 271 aa  45.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0458297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>