67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  94.92 
 
 		 1200 aa  1934    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  63.07 
 
 		 1198 aa  1184    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  63.37 
 
 		 1207 aa  1078    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  100 
 
 		 1201 aa  2281    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1128 aa  565  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  40.52 
 
 		 1242 aa  512  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  52.4 
 
 		 939 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  51.06 
 
 		 957 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  46.53 
 
 		 938 aa  393  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  53.05 
 
 		 1139 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  53.05 
 
 		 1133 aa  373  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  44.44 
 
 		 953 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  43.31 
 
 		 1124 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  43.15 
 
 		 1130 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  43.15 
 
 		 1155 aa  367  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  47.42 
 
 		 1093 aa  352  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  40.83 
 
 		 949 aa  350  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  51.54 
 
 		 1133 aa  346  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  50.35 
 
 		 1146 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  41.46 
 
 		 989 aa  318  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  37.09 
 
 		 973 aa  304  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  48.45 
 
 		 903 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  36.35 
 
 		 902 aa  294  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  45.82 
 
 		 891 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  39.07 
 
 		 946 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  42.92 
 
 		 941 aa  254  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  42.54 
 
 		 774 aa  250  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  30.2 
 
 		 1045 aa  160  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.22 
 
 		 778 aa  140  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.54 
 
 		 833 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.41 
 
 		 587 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  24.47 
 
 		 824 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.13 
 
 		 921 aa  115  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  26.78 
 
 		 600 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 1312 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.64 
 
 		 823 aa  80.9  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  28.43 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  29.58 
 
 		 915 aa  58.9  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  33.82 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  29.48 
 
 		 915 aa  57.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  25.91 
 
 		 939 aa  54.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1070 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  22.81 
 
 		 906 aa  52.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0670  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  52.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  31.25 
 
 		 899 aa  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1070 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  25.34 
 
 		 954 aa  51.6  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.32 
 
 		 954 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  23.44 
 
 		 847 aa  50.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  38 
 
 		 893 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 679 aa  50.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  21.74 
 
 		 573 aa  48.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  21.73 
 
 		 616 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  29.84 
 
 		 569 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1063 aa  47.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 901 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2397  extensin family protein  30 
 
 		 362 aa  46.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1064 aa  46.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  18.82 
 
 		 884 aa  45.8  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1048 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  21.93 
 
 		 850 aa  45.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1048 aa  45.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  27.94 
 
 		 355 aa  45.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  30.84 
 
 		 268 aa  45.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  32.58 
 
 		 316 aa  45.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  28.24 
 
 		 350 aa  45.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>