27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3151 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  46.66 
 
 		 1045 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1065 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  43.92 
 
 		 1013 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  46.54 
 
 		 1070 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  46.62 
 
 		 1048 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  46.62 
 
 		 1048 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  50.19 
 
 		 1019 aa  904    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  46.35 
 
 		 1048 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  47.59 
 
 		 1070 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 1064 aa  2119    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  47 
 
 		 1063 aa  787    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  44.99 
 
 		 616 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  48.1 
 
 		 449 aa  349  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.93 
 
 		 921 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.42 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.65 
 
 		 833 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.5 
 
 		 824 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.23 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  29.3 
 
 		 1093 aa  59.7  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  24.92 
 
 		 1312 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  32.26 
 
 		 938 aa  52.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  24.22 
 
 		 957 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  24.05 
 
 		 906 aa  49.3  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  30.65 
 
 		 953 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  20.54 
 
 		 949 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  25.16 
 
 		 946 aa  46.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  20.34 
 
 		 902 aa  45.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>