28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1096 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  70.26 
 
 		 1070 aa  1363    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  69.86 
 
 		 1070 aa  1342    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  48.03 
 
 		 1013 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  70.88 
 
 		 1065 aa  1344    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  67.69 
 
 		 616 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  69.81 
 
 		 1063 aa  1300    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  46.66 
 
 		 1064 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  78.13 
 
 		 1048 aa  1486    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1019 aa  841    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  79.66 
 
 		 1048 aa  1488    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  79 
 
 		 1048 aa  1478    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 1045 aa  2078    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  72.54 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  24.49 
 
 		 824 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.07 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  22.73 
 
 		 778 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.47 
 
 		 600 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  24.78 
 
 		 921 aa  61.6  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  23.69 
 
 		 1312 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  25 
 
 		 946 aa  54.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.57 
 
 		 573 aa  52  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.9 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  20.62 
 
 		 906 aa  48.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  21.81 
 
 		 949 aa  46.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 823 aa  46.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  24.08 
 
 		 973 aa  45.8  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  24.77 
 
 		 938 aa  45.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  37.33 
 
 		 920 aa  45.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>