55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2460 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  47.42 
 
 		 941 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  35.78 
 
 		 939 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  35.69 
 
 		 957 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  35.42 
 
 		 953 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  33.4 
 
 		 949 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  31.88 
 
 		 902 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  36.68 
 
 		 1093 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  35.85 
 
 		 1139 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  35.84 
 
 		 1133 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.72 
 
 		 1155 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 1130 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 1124 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  35.64 
 
 		 1133 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  45.94 
 
 		 938 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  36.77 
 
 		 973 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  40.85 
 
 		 989 aa  257  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1200 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1198 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  36.62 
 
 		 1146 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  40 
 
 		 1201 aa  252  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  39.79 
 
 		 903 aa  235  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1128 aa  220  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  35.79 
 
 		 1207 aa  212  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  36.93 
 
 		 1242 aa  211  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  36.74 
 
 		 891 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  30.92 
 
 		 600 aa  158  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  28.66 
 
 		 1045 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  23.54 
 
 		 778 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.98 
 
 		 823 aa  93.6  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  25.5 
 
 		 587 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.89 
 
 		 833 aa  89  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.14 
 
 		 824 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.53 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  23.16 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  23.66 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  23.66 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.05 
 
 		 1312 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  23.57 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  23.3 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  23.3 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.94 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  23.57 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  32.8 
 
 		 774 aa  68.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.56 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  27.53 
 
 		 939 aa  67.8  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  21.43 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  21.65 
 
 		 850 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.18 
 
 		 906 aa  48.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  25 
 
 		 1019 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  23.66 
 
 		 954 aa  45.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1064 aa  45.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  24.24 
 
 		 847 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.39 
 
 		 954 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  22.96 
 
 		 884 aa  45.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>