52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3218 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  59.66 
 
 		 774 aa  759    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1705    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  39.84 
 
 		 957 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  39.71 
 
 		 953 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  40.7 
 
 		 938 aa  429  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  38.87 
 
 		 989 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  36.55 
 
 		 939 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.34 
 
 		 973 aa  360  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  38.28 
 
 		 1155 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  38.28 
 
 		 1130 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  38.28 
 
 		 1124 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  39.62 
 
 		 949 aa  344  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  41.86 
 
 		 1139 aa  337  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  46.85 
 
 		 1133 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  40.59 
 
 		 1133 aa  330  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  48.59 
 
 		 1093 aa  323  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  35.66 
 
 		 1146 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1201 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1200 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1198 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  32 
 
 		 946 aa  280  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  41.88 
 
 		 902 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  45.08 
 
 		 903 aa  278  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  42.44 
 
 		 1207 aa  250  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  39.36 
 
 		 1128 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  40.55 
 
 		 941 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1242 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  27.8 
 
 		 1045 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.81 
 
 		 833 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.04 
 
 		 778 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  27.66 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  25.79 
 
 		 824 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.62 
 
 		 921 aa  90.9  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  26.12 
 
 		 600 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.18 
 
 		 823 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  28.39 
 
 		 934 aa  64.3  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 1312 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  25.29 
 
 		 850 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  23.08 
 
 		 573 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  22.95 
 
 		 573 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  23.16 
 
 		 856 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  24.74 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  24.78 
 
 		 939 aa  48.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  22.78 
 
 		 906 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  28.07 
 
 		 847 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.65 
 
 		 573 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.65 
 
 		 573 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.65 
 
 		 573 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0670  hypothetical protein  35.05 
 
 		 257 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.3 
 
 		 573 aa  44.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.73 
 
 		 573 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  29.63 
 
 		 899 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>