42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2614 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  100 
 
 
939 aa  1806    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  36.3 
 
 
915 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  36.67 
 
 
915 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  31.14 
 
 
847 aa  94.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  31.28 
 
 
920 aa  94.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
954 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
954 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  34.55 
 
 
894 aa  89.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.23 
 
 
906 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  35.85 
 
 
934 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  40.16 
 
 
901 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  24.58 
 
 
884 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  39.29 
 
 
893 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  34.07 
 
 
926 aa  73.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  33.87 
 
 
899 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  35.08 
 
 
900 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  35.08 
 
 
900 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  25.56 
 
 
946 aa  68.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  38.73 
 
 
910 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  24.15 
 
 
949 aa  62.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  19.61 
 
 
823 aa  55.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.46 
 
 
1093 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24 
 
 
573 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  25.57 
 
 
957 aa  51.6  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  25.32 
 
 
1198 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.53 
 
 
573 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  23.29 
 
 
902 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  24.48 
 
 
1312 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  22.3 
 
 
921 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  32.28 
 
 
587 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  21.6 
 
 
573 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  27.42 
 
 
938 aa  49.3  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.11 
 
 
573 aa  48.5  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  25.64 
 
 
1201 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  20.57 
 
 
778 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  21.75 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  21.75 
 
 
573 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  21.75 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  21.92 
 
 
573 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.26 
 
 
573 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  28.95 
 
 
850 aa  45.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  21.74 
 
 
824 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>