43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1379 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 920 aa  1725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  41.4 
 
 		 899 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  41.05 
 
 		 894 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  43.25 
 
 		 893 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 901 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  27.99 
 
 		 954 aa  197  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  27.48 
 
 		 954 aa  194  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  27.84 
 
 		 847 aa  148  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  41.41 
 
 		 900 aa  148  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  41.5 
 
 		 900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  49.19 
 
 		 910 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  40.67 
 
 		 926 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  30.95 
 
 		 934 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  27 
 
 		 906 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  30.58 
 
 		 939 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  24.16 
 
 		 884 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  37.02 
 
 		 915 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  37.02 
 
 		 915 aa  75.5  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  26.85 
 
 		 1312 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  23.55 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.01 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  31.82 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  21.85 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1128 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  23.04 
 
 		 778 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  22.74 
 
 		 824 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1242 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  26.67 
 
 		 938 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  21.99 
 
 		 949 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.97 
 
 		 573 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  37.31 
 
 		 1146 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 1133 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  29.64 
 
 		 939 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  23.71 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  37.66 
 
 		 639 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 1139 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 1130 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  42.37 
 
 		 1133 aa  45.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  42.37 
 
 		 1155 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 1124 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1045 aa  45.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  36.76 
 
 		 953 aa  44.3  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  20.81 
 
 		 573 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>