26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7071 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1183    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3578  hypothetical protein  35.71 
 
 		 604 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214461  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  33.44 
 
 		 679 aa  98.2  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2837  hypothetical protein  44.05 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3088  hypothetical protein  44.17 
 
 		 597 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3029  hypothetical protein  44.17 
 
 		 597 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3045  hypothetical protein  43.56 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  28.02 
 
 		 954 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.02 
 
 		 954 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.22 
 
 		 833 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  35 
 
 		 894 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  37.5 
 
 		 926 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  33.94 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  35.06 
 
 		 899 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  36.99 
 
 		 901 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  37.66 
 
 		 920 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  41.67 
 
 		 1155 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  27.08 
 
 		 934 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 1124 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 1130 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  40 
 
 		 938 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.18 
 
 		 823 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  36.03 
 
 		 601 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  40.28 
 
 		 1133 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 1133 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 1139 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>