24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0888 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1103    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2837  hypothetical protein  39.02 
 
 		 614 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3578  hypothetical protein  38.92 
 
 		 604 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214461  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  35.75 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3045  hypothetical protein  49.1 
 
 		 593 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3029  hypothetical protein  49.1 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3088  hypothetical protein  49.1 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  43.31 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.89 
 
 		 573 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.2 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.36 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  21.69 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.5 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.87 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.87 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.38 
 
 		 573 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.91 
 
 		 573 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.68 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  33.82 
 
 		 957 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  33.82 
 
 		 938 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  32.1 
 
 		 850 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  32.35 
 
 		 953 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1242 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>