64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0802 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  59.35 
 
 		 1133 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  53.48 
 
 		 1130 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  54.71 
 
 		 1146 aa  745    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  54.17 
 
 		 989 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  100 
 
 		 957 aa  1840    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  60.27 
 
 		 1133 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  94.15 
 
 		 953 aa  1548    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  79.43 
 
 		 938 aa  1332    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  53.59 
 
 		 1124 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  59.73 
 
 		 1139 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  53.48 
 
 		 1155 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  54.86 
 
 		 1093 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  40.09 
 
 		 949 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  43.13 
 
 		 939 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  42.22 
 
 		 903 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.81 
 
 		 973 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  37.53 
 
 		 902 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  35.94 
 
 		 946 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  40 
 
 		 891 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  39.19 
 
 		 941 aa  376  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  44.04 
 
 		 1201 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  51.59 
 
 		 1200 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  46.38 
 
 		 774 aa  325  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1198 aa  323  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  46.27 
 
 		 1207 aa  312  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  37.87 
 
 		 1242 aa  257  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1128 aa  248  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  31.21 
 
 		 1045 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.96 
 
 		 833 aa  141  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.03 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.09 
 
 		 600 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  25.41 
 
 		 778 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  33.15 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  24.9 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  30.32 
 
 		 1312 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.93 
 
 		 823 aa  80.1  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  28.36 
 
 		 934 aa  60.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  27.82 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  26.25 
 
 		 573 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  32.16 
 
 		 893 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  23.21 
 
 		 573 aa  55.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  32.97 
 
 		 894 aa  54.3  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.71 
 
 		 906 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.19 
 
 		 573 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1064 aa  52.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.74 
 
 		 573 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.01 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.01 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  26.61 
 
 		 954 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.46 
 
 		 573 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.38 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.1 
 
 		 573 aa  48.9  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  22.85 
 
 		 884 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  27.16 
 
 		 939 aa  48.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.92 
 
 		 573 aa  48.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  23.26 
 
 		 850 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 901 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  28.47 
 
 		 915 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  26.36 
 
 		 954 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1019 aa  46.2  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  31.28 
 
 		 900 aa  45.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  31.28 
 
 		 900 aa  45.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  31.71 
 
 		 601 aa  45.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  27.34 
 
 		 847 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>