16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3578 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3578  hypothetical protein  100 
 
 
604 aa  1134    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214461  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2837  hypothetical protein  79.45 
 
 
614 aa  611  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3045  hypothetical protein  61.6 
 
 
593 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3029  hypothetical protein  61.94 
 
 
597 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3088  hypothetical protein  61.94 
 
 
597 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  37.52 
 
 
679 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  39.16 
 
 
601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  34.34 
 
 
639 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  35.64 
 
 
1093 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  44.93 
 
 
1146 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  30.54 
 
 
957 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  36.36 
 
 
934 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  33.1 
 
 
1200 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  39.22 
 
 
954 aa  43.9  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  39.22 
 
 
954 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  23.76 
 
 
573 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>