66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1674 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  53.34 
 
 		 938 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  48.88 
 
 		 989 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  50.66 
 
 		 1130 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  55.75 
 
 		 1133 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  50.66 
 
 		 1124 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  56.25 
 
 		 1139 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  50.36 
 
 		 1146 aa  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  54.93 
 
 		 953 aa  721    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  50.66 
 
 		 1155 aa  903    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1093 aa  2095    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  55.77 
 
 		 957 aa  773    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  55.04 
 
 		 1133 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  36.6 
 
 		 949 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  40 
 
 		 902 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  34.84 
 
 		 973 aa  370  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  40.73 
 
 		 903 aa  366  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  36.85 
 
 		 939 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  36.26 
 
 		 946 aa  358  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  51.12 
 
 		 1201 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  48.2 
 
 		 1200 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  51.68 
 
 		 891 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  46.74 
 
 		 1198 aa  298  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  44.25 
 
 		 774 aa  298  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  39.58 
 
 		 1207 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1128 aa  257  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  42.53 
 
 		 941 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  44.13 
 
 		 1242 aa  234  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  27.92 
 
 		 1045 aa  145  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.72 
 
 		 778 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 600 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.92 
 
 		 824 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.73 
 
 		 833 aa  126  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.9 
 
 		 587 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.45 
 
 		 823 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.01 
 
 		 921 aa  87.8  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  26.7 
 
 		 1312 aa  75.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  29.41 
 
 		 934 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1064 aa  58.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.84 
 
 		 573 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  21.7 
 
 		 573 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  26.46 
 
 		 939 aa  52.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  22.71 
 
 		 573 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  26.07 
 
 		 954 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  26.07 
 
 		 954 aa  51.6  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  21.67 
 
 		 573 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22 
 
 		 573 aa  50.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  21.67 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  21.67 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  30.97 
 
 		 569 aa  48.9  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  21.5 
 
 		 573 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  36.19 
 
 		 899 aa  48.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1065 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  21 
 
 		 573 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  22.98 
 
 		 856 aa  47.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1048 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  25.99 
 
 		 847 aa  47.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1070 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1013 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1045 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1048 aa  45.8  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1048 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  21.81 
 
 		 573 aa  45.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  36.94 
 
 		 894 aa  45.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  29.78 
 
 		 893 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>