70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0453 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  54.82 
 
 		 938 aa  796    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  83.58 
 
 		 1139 aa  1664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  55.06 
 
 		 953 aa  768    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  85.51 
 
 		 1124 aa  1731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  85.42 
 
 		 1155 aa  1729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  100 
 
 		 1133 aa  2189    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  69.53 
 
 		 989 aa  1076    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  54.76 
 
 		 957 aa  828    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  61.88 
 
 		 1146 aa  1238    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  85.42 
 
 		 1130 aa  1731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  49.65 
 
 		 1093 aa  869    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  83.8 
 
 		 1133 aa  1675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  39.69 
 
 		 939 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  36.44 
 
 		 949 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.26 
 
 		 973 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  51.76 
 
 		 1201 aa  373  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  34.75 
 
 		 902 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1200 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  38.93 
 
 		 903 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  34.73 
 
 		 946 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  47.12 
 
 		 1198 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  44.91 
 
 		 774 aa  320  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  39.92 
 
 		 891 aa  316  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  35.42 
 
 		 941 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  45.71 
 
 		 1207 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1128 aa  247  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  42.32 
 
 		 1242 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  28.1 
 
 		 1045 aa  159  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 600 aa  144  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  26.56 
 
 		 833 aa  142  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  25.94 
 
 		 778 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  32.62 
 
 		 587 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.56 
 
 		 824 aa  131  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.15 
 
 		 823 aa  104  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.72 
 
 		 921 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.81 
 
 		 1312 aa  86.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  26.45 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  23.95 
 
 		 573 aa  67  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  25.19 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.2 
 
 		 954 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  23.95 
 
 		 954 aa  65.1  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  24 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  24 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  24 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.25 
 
 		 906 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  24.79 
 
 		 573 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  23.95 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  24.71 
 
 		 573 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  26.91 
 
 		 934 aa  62  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  24 
 
 		 573 aa  61.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1064 aa  58.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  29.79 
 
 		 894 aa  56.2  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  25.14 
 
 		 856 aa  55.5  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  38.57 
 
 		 316 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1019 aa  53.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  29.24 
 
 		 893 aa  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1001  hypothetical protein  28.45 
 
 		 325 aa  51.6  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1170  sporulation domain-containing protein  29.94 
 
 		 300 aa  51.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  36.87 
 
 		 679 aa  50.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  28.02 
 
 		 899 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.6 
 
 		 850 aa  50.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  29.96 
 
 		 915 aa  48.9  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  24.2 
 
 		 847 aa  47.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  26.26 
 
 		 939 aa  47  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1013  hypothetical protein  26.09 
 
 		 238 aa  47  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.568578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  27.52 
 
 		 915 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  40.32 
 
 		 920 aa  45.8  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1070 aa  45.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  41.94 
 
 		 901 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>