40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02114 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  60.03 
 
 		 891 aa  739    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1475    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  40.1 
 
 		 957 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  39.72 
 
 		 938 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  40.25 
 
 		 953 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  38.43 
 
 		 989 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  36.35 
 
 		 973 aa  334  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  37.2 
 
 		 939 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  40.81 
 
 		 1124 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  40.81 
 
 		 1130 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  40.81 
 
 		 1155 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  40.9 
 
 		 1139 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  40.51 
 
 		 1133 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  37.95 
 
 		 1133 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  49.21 
 
 		 1093 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  38.07 
 
 		 1146 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  36.29 
 
 		 903 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  41.91 
 
 		 949 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  39.72 
 
 		 902 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  42.54 
 
 		 1201 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  42.79 
 
 		 1200 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1198 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  46.44 
 
 		 1207 aa  226  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  38.53 
 
 		 941 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1128 aa  198  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  42.57 
 
 		 1242 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  30.68 
 
 		 1045 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  27.56 
 
 		 778 aa  111  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  31.1 
 
 		 587 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.22 
 
 		 824 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 600 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  28.89 
 
 		 833 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  32.57 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.96 
 
 		 921 aa  70.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  29.92 
 
 		 1312 aa  70.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.71 
 
 		 850 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  26.19 
 
 		 823 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  29.57 
 
 		 573 aa  47.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  26.09 
 
 		 573 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  26.96 
 
 		 573 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>