75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1520 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  100 
 
 		 823 aa  1659    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  31.14 
 
 		 824 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  28.71 
 
 		 833 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  28.25 
 
 		 778 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.44 
 
 		 949 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  24.21 
 
 		 902 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  26.9 
 
 		 600 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  24.66 
 
 		 587 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  23.03 
 
 		 973 aa  107  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.36 
 
 		 1312 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  21.45 
 
 		 850 aa  105  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  22.98 
 
 		 946 aa  101  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.15 
 
 		 921 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  24.15 
 
 		 957 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1198 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  25.34 
 
 		 938 aa  90.9  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  22.55 
 
 		 1093 aa  90.9  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  22.75 
 
 		 939 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.61 
 
 		 934 aa  89  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 1133 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 1139 aa  87.8  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1128 aa  87  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  25.96 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  24.5 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  24.51 
 
 		 953 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  26.67 
 
 		 1133 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  24.17 
 
 		 573 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  25.26 
 
 		 573 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  22.55 
 
 		 1146 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  25.26 
 
 		 573 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  24.82 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  24.25 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  23.84 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  23.17 
 
 		 903 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  25.76 
 
 		 1155 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.1 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  25.76 
 
 		 1124 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 1130 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.82 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1200 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1201 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  26.5 
 
 		 989 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  22.59 
 
 		 941 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  27.71 
 
 		 891 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  23.05 
 
 		 847 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1242 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  27.27 
 
 		 926 aa  61.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  23.02 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  23.88 
 
 		 1045 aa  60.1  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  26.95 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1013 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  29.95 
 
 		 894 aa  57.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  23.02 
 
 		 915 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  24.92 
 
 		 774 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  26.88 
 
 		 893 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.54 
 
 		 954 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  24.54 
 
 		 954 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  22.14 
 
 		 906 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  26.74 
 
 		 899 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  20.37 
 
 		 939 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  25.42 
 
 		 856 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  26 
 
 		 910 aa  52  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  23.44 
 
 		 900 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  23.44 
 
 		 900 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  21.68 
 
 		 1207 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1070 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  20.43 
 
 		 884 aa  48.9  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  24.15 
 
 		 920 aa  48.5  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1063 aa  48.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1045 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  25.27 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1070 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0607  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1278 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.591386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1048 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>