23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3866 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  48.36 
 
 		 1045 aa  797    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  48.61 
 
 		 1065 aa  827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 1013 aa  2018    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  47.78 
 
 		 1048 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  47.74 
 
 		 1048 aa  769    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  45.44 
 
 		 1019 aa  761    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1048 aa  793    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  48.75 
 
 		 1070 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  43.9 
 
 		 1064 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1063 aa  791    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  48.89 
 
 		 1070 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  48.08 
 
 		 616 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  48.6 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  22.22 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.04 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  22.99 
 
 		 824 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.26 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  21.69 
 
 		 823 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  20.73 
 
 		 884 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.08 
 
 		 949 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  22.8 
 
 		 1312 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  30 
 
 		 938 aa  48.5  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>