22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3570 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  70.07 
 
 
1045 aa  1302    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  96.26 
 
 
1065 aa  1951    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  48.75 
 
 
1013 aa  807    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  100 
 
 
1070 aa  2129    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  96.66 
 
 
449 aa  829    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  96.62 
 
 
616 aa  1131    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  89.01 
 
 
1063 aa  1743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  46.54 
 
 
1064 aa  757    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  96.64 
 
 
1070 aa  1991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  69.42 
 
 
1048 aa  1283    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  48.52 
 
 
1019 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  69.32 
 
 
1048 aa  1254    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  69.65 
 
 
1048 aa  1253    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  27.27 
 
 
778 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  28.75 
 
 
824 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.7 
 
 
921 aa  68.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  28.75 
 
 
833 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  24.47 
 
 
1312 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.71 
 
 
600 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  28.48 
 
 
291 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  24.03 
 
 
949 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.03 
 
 
938 aa  45.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.447385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>