22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0929 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  79 
 
 		 1045 aa  1511    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  69.78 
 
 		 1065 aa  1328    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  48.02 
 
 		 1013 aa  790    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  69.74 
 
 		 1070 aa  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  67.47 
 
 		 616 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  69.94 
 
 		 1063 aa  1292    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  47.18 
 
 		 1064 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  69.27 
 
 		 1070 aa  1351    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  93.8 
 
 		 1048 aa  1780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1019 aa  814    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  97.14 
 
 		 1048 aa  1833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 1048 aa  2075    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  71.43 
 
 		 449 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  24.56 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  23.1 
 
 		 833 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  23.82 
 
 		 778 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  24.31 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.48 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.44 
 
 		 1312 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  22.76 
 
 		 949 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.21 
 
 		 1093 aa  47.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.03 
 
 		 938 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>