24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0967 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  79.66 
 
 		 1045 aa  1524    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  69.59 
 
 		 1065 aa  1327    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  48.25 
 
 		 1013 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  69.45 
 
 		 1070 aa  1325    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  66.67 
 
 		 616 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  69.65 
 
 		 1063 aa  1285    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  47.09 
 
 		 1064 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  69.36 
 
 		 1070 aa  1347    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  94.27 
 
 		 1048 aa  1795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  48.08 
 
 		 1019 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  100 
 
 		 1048 aa  2075    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  97.14 
 
 		 1048 aa  1833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  72.1 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.14 
 
 		 921 aa  71.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.15 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  26.54 
 
 		 778 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  29.3 
 
 		 824 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.4 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  23.27 
 
 		 1312 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  19.89 
 
 		 850 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.1 
 
 		 906 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  25.52 
 
 		 1093 aa  45.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  27.39 
 
 		 938 aa  45.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.31 
 
 		 949 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>