27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0187 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1045 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  49.02 
 
 		 1065 aa  872    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1013 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  48.52 
 
 		 1070 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  48.14 
 
 		 1048 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  48.04 
 
 		 1048 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 1019 aa  2035    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  47.94 
 
 		 1048 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  48.98 
 
 		 1070 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  50.19 
 
 		 1064 aa  876    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  48.88 
 
 		 1063 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  47.27 
 
 		 616 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3446  hypothetical protein  50.44 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  27.16 
 
 		 824 aa  78.2  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  30.86 
 
 		 778 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.84 
 
 		 833 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.93 
 
 		 921 aa  65.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  24.68 
 
 		 946 aa  52  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  21.43 
 
 		 600 aa  50.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  21.5 
 
 		 949 aa  48.9  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.11 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.46 
 
 		 938 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  23.44 
 
 		 973 aa  47.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  24.33 
 
 		 957 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  21.33 
 
 		 1312 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  23.81 
 
 		 906 aa  44.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  29.13 
 
 		 953 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>