32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000728 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  100 
 
 		 884 aa  1777    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  64.43 
 
 		 906 aa  1178    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.61 
 
 		 954 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  28.61 
 
 		 954 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  26.79 
 
 		 847 aa  93.2  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  23.49 
 
 		 899 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  21.37 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  26.82 
 
 		 926 aa  79  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  25.75 
 
 		 901 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  30.9 
 
 		 894 aa  74.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  24.58 
 
 		 939 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  30.06 
 
 		 893 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  33.52 
 
 		 915 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  32.97 
 
 		 915 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  31.31 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  29.21 
 
 		 900 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  29.21 
 
 		 900 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  23.66 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  40.82 
 
 		 910 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.61 
 
 		 949 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  22.63 
 
 		 973 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 1312 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  22.31 
 
 		 921 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  22.85 
 
 		 957 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  22.51 
 
 		 902 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  25.1 
 
 		 1045 aa  47  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  31.25 
 
 		 587 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.6 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.13 
 
 		 778 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1063 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1013 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  21.04 
 
 		 573 aa  44.3  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>