30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0678 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 915 aa  1687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  98.36 
 
 		 915 aa  1657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  37.12 
 
 		 939 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  36.02 
 
 		 954 aa  97.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  36.02 
 
 		 954 aa  97.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  30.87 
 
 		 847 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  28.16 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  26.06 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  36.54 
 
 		 920 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  38.51 
 
 		 894 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  33.77 
 
 		 884 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 901 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  37.3 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  37.3 
 
 		 900 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  39.22 
 
 		 899 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  29.43 
 
 		 926 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  35.83 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.73 
 
 		 1312 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  26.81 
 
 		 949 aa  57.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.26 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1198 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  28.47 
 
 		 957 aa  51.2  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  18.79 
 
 		 778 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  29.96 
 
 		 939 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.51 
 
 		 823 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  29.22 
 
 		 921 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  26.74 
 
 		 973 aa  47.8  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1200 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1201 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  38.03 
 
 		 587 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>