50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4197 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  98.22 
 
 		 900 aa  1613    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  83.43 
 
 		 910 aa  958    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 900 aa  1645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  36.47 
 
 		 894 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  38.3 
 
 		 893 aa  281  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  41.18 
 
 		 899 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  34.52 
 
 		 926 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  28.15 
 
 		 847 aa  152  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  39.76 
 
 		 920 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  50 
 
 		 901 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  34.88 
 
 		 915 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  34.37 
 
 		 915 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  33.05 
 
 		 954 aa  97.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  34.12 
 
 		 954 aa  95.9  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  33.33 
 
 		 939 aa  95.1  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.98 
 
 		 906 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  30.58 
 
 		 934 aa  82  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 957 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  24.14 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  44.59 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  30.47 
 
 		 953 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.36 
 
 		 938 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  23.7 
 
 		 949 aa  59.7  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.05 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  33.14 
 
 		 1093 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1201 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  29.21 
 
 		 946 aa  55.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  54.7  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1198 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  30.88 
 
 		 939 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  29.8 
 
 		 973 aa  53.5  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1200 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  22.09 
 
 		 600 aa  50.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  29.04 
 
 		 902 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  22.29 
 
 		 573 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  24.87 
 
 		 573 aa  47.8  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 1146 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1128 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 1312 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.79 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  23.96 
 
 		 573 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  33.07 
 
 		 989 aa  45.8  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  32.19 
 
 		 639 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  27.33 
 
 		 891 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1242 aa  44.3  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>