48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5166 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  100 
 
 		 939 aa  1834    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  43.07 
 
 		 957 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  41.24 
 
 		 953 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  63.89 
 
 		 1198 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  43.84 
 
 		 938 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  60.18 
 
 		 1200 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  54.83 
 
 		 1201 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  37.81 
 
 		 949 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  43.09 
 
 		 989 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  62.32 
 
 		 1207 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  38.63 
 
 		 903 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  40.81 
 
 		 1133 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  40.47 
 
 		 1139 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  38.56 
 
 		 1155 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  38.56 
 
 		 1130 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  34.67 
 
 		 973 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  38.56 
 
 		 1124 aa  406  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  36.05 
 
 		 946 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  40.88 
 
 		 1133 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  33.86 
 
 		 902 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  40.46 
 
 		 1146 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  35.96 
 
 		 941 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  39.16 
 
 		 1093 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  36.28 
 
 		 891 aa  325  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  45.5 
 
 		 1128 aa  303  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  52.45 
 
 		 1242 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  45.07 
 
 		 774 aa  265  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  31.03 
 
 		 1045 aa  160  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  27.58 
 
 		 600 aa  149  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  32.38 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  22.7 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.86 
 
 		 833 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 921 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  30.81 
 
 		 824 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.75 
 
 		 823 aa  85.1  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.16 
 
 		 1312 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  30.88 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  32.68 
 
 		 894 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  29.79 
 
 		 915 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  30.89 
 
 		 934 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.15 
 
 		 850 aa  52  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  28.37 
 
 		 899 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  29.82 
 
 		 893 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.64 
 
 		 954 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  30.53 
 
 		 954 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  22.96 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.59 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  30 
 
 		 901 aa  44.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>