27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2332 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  98.36 
 
 		 915 aa  1657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 915 aa  1683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  36.88 
 
 		 939 aa  358  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  29.55 
 
 		 954 aa  98.2  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  30.87 
 
 		 847 aa  97.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  36.02 
 
 		 954 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  26.6 
 
 		 934 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  36.54 
 
 		 920 aa  81.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  34.88 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  34.42 
 
 		 884 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  38.51 
 
 		 894 aa  75.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  33.85 
 
 		 926 aa  75.1  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  24.38 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  36.76 
 
 		 900 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  32.77 
 
 		 901 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  36.76 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  39.22 
 
 		 899 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  40.68 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.84 
 
 		 1312 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  26.97 
 
 		 949 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  21.48 
 
 		 823 aa  52.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  21.43 
 
 		 833 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  19.15 
 
 		 778 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  28.64 
 
 		 939 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.66 
 
 		 921 aa  45.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  38.03 
 
 		 587 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1200 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>