More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2198 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1044  HpcH/HpaI aldolase  99.05 
 
 		 315 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2198  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 315 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1411  HpcH/HpaI aldolase  95.48 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0970  HpcH/HpaI aldolase  95.48 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0326434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1111  HpcH/HpaI aldolase  49.07 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.761795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1180  HpcH/HpaI aldolase  41.73 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451315  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  34.8 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.87 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.82 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.82 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  32.81 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.04 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.4 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.84 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  31.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.2 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  30.12 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  29.76 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  31.91 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.76 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.98 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.68 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.61 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  29.06 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.17 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  33.47 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  32.95 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  30.98 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  31.85 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  30.18 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  29.93 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  32.05 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  26.74 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  31.27 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  31.12 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  31.47 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  26.74 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  30.5 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  32.18 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  29.45 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  29.31 
 
 		 406 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  29.12 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  31.8 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  30.77 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  30.77 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  27.69 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  32.13 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  30.62 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  31.36 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  30.82 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  31.02 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  29.96 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  27.24 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  33.59 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  29.03 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  29.63 
 
 		 271 aa  86.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  29.08 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  25.35 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  28.52 
 
 		 338 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  28.14 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  29.47 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.42 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  32.79 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.57 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  29.62 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  32.78 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  27.82 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.18 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  28.77 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  29.72 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  26.95 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  31.34 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  29.34 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.08 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  29.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  27.8 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  28.98 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4207  Citryl-CoA lyase  26.89 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  29.68 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  27.61 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  31.1 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  29.18 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  27.18 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  27.14 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  27.36 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  27.98 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  29.01 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  28.98 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  28.52 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  27.65 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  27.56 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>