More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6654 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6654  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  871    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2906  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0428015  normal  0.0913658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  28.4 
 
 		 582 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.57 
 
 		 646 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.57 
 
 		 646 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 		 646 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 		 514 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 585 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  29.27 
 
 		 582 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  28.86 
 
 		 582 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1065 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 		 469 aa  90.1  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 493 aa  90.1  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 523 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.94 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 558 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 579 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.05 
 
 		 582 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.42 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 609 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 		 510 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.9 
 
 		 489 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 528 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.89 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
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NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 583 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  33.9 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.93 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.03 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.85 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  32.3 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 697 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  34.83 
 
 		 579 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  36.42 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.94 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  36.42 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  36.42 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
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