More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04380 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  48.12 
 
 
851 aa  868    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  48.97 
 
 
935 aa  910    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  100 
 
 
884 aa  1831    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25666  predicted protein  43.02 
 
 
885 aa  738    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26 
 
 
1163 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 
947 aa  184  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.1 
 
 
696 aa  177  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.23 
 
 
1196 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.46 
 
 
1523 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.53 
 
 
1652 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.73 
 
 
1510 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
1193 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.84 
 
 
1553 aa  165  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.49 
 
 
1686 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.63 
 
 
1161 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.63 
 
 
1161 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 
1789 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
1831 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.23 
 
 
1481 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.43 
 
 
1557 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.49 
 
 
1221 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 
1363 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.93 
 
 
1454 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 
1656 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 
1236 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.48 
 
 
919 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.52 
 
 
1901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.04 
 
 
1367 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.69 
 
 
1364 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 
1760 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 
1188 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.61 
 
 
1213 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 
1552 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.64 
 
 
1357 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.29 
 
 
1217 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 
1807 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.04 
 
 
565 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.56 
 
 
677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.79 
 
 
1714 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.76 
 
 
1626 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
1211 aa  135  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 
1661 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 
1711 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.24 
 
 
608 aa  133  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.48 
 
 
1474 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 
1164 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.15 
 
 
930 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 
1004 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.14 
 
 
1609 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.09 
 
 
1190 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.86 
 
 
1617 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 
1598 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.93 
 
 
596 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.18 
 
 
676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.61 
 
 
1684 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.89 
 
 
576 aa  128  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1583 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.74 
 
 
1599 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.91 
 
 
1443 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  22.66 
 
 
1858 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 
1856 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 
1766 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 
1190 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.96 
 
 
740 aa  125  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.96 
 
 
742 aa  125  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.59 
 
 
589 aa  124  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.77 
 
 
1868 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
1240 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 
1247 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  30.51 
 
 
344 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.55 
 
 
1823 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.82 
 
 
344 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.8 
 
 
1607 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.44 
 
 
464 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.63 
 
 
1484 aa  121  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 
1188 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 
1177 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.84 
 
 
1262 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.85 
 
 
1242 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.16 
 
 
335 aa  118  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 
1348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.14 
 
 
1208 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.5 
 
 
924 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
687 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  29.36 
 
 
778 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.36 
 
 
1623 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.84 
 
 
1229 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  21.71 
 
 
1373 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.48 
 
 
1209 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.65 
 
 
1039 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  31.27 
 
 
1041 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.8 
 
 
698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.75 
 
 
664 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 
1176 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  22.9 
 
 
1280 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.89 
 
 
1547 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.67 
 
 
564 aa  111  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 
578 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  27.14 
 
 
774 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
1214 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>