More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01700 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01700  translation repressor, putative  100 
 
 
1496 aa  3055    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03014  translation repressor/antiviral protein Ski3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08810)  27.18 
 
 
1410 aa  403  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.690097 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43936  antiviral protein  23.77 
 
 
1413 aa  261  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 
878 aa  92.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.52 
 
 
810 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
927 aa  78.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.82 
 
 
573 aa  73.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.52 
 
 
818 aa  69.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
562 aa  68.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 
632 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 
1694 aa  66.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27846  predicted protein  25.59 
 
 
1353 aa  65.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659995  normal  0.572567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
366 aa  65.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.09 
 
 
576 aa  64.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.7 
 
 
863 aa  64.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
3145 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.85 
 
 
564 aa  63.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
4079 aa  63.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
687 aa  63.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
1297 aa  62  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.85 
 
 
1013 aa  61.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
202 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.53 
 
 
397 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.88 
 
 
936 aa  60.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
245 aa  60.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
1069 aa  60.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.73 
 
 
832 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  31.68 
 
 
407 aa  60.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.6 
 
 
626 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.38 
 
 
1067 aa  58.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 
409 aa  58.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.67 
 
 
1138 aa  58.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.3 
 
 
707 aa  58.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.06 
 
 
1007 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.78 
 
 
730 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
1276 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 
602 aa  57.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.4 
 
 
620 aa  58.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 
554 aa  57.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.56 
 
 
439 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  20.08 
 
 
417 aa  56.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
512 aa  57  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
808 aa  57  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
836 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 
3172 aa  57  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.16 
 
 
887 aa  56.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
465 aa  56.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  22.08 
 
 
750 aa  55.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  23.08 
 
 
626 aa  55.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.87 
 
 
1676 aa  55.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 
2240 aa  55.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
1486 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 
290 aa  55.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
718 aa  55.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.08 
 
 
626 aa  55.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
337 aa  55.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.56 
 
 
439 aa  55.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.37 
 
 
1000 aa  55.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
301 aa  55.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.34 
 
 
266 aa  54.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.98 
 
 
738 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  21.35 
 
 
1101 aa  55.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.51 
 
 
1979 aa  55.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.27 
 
 
668 aa  55.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  23.05 
 
 
614 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.05 
 
 
614 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.52 
 
 
436 aa  55.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38886  predicted protein  28.87 
 
 
648 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.04 
 
 
622 aa  55.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
614 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  22.47 
 
 
577 aa  53.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
614 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.12 
 
 
1022 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
357 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
471 aa  54.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 
267 aa  53.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 
635 aa  54.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 
643 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.29 
 
 
764 aa  54.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
213 aa  53.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
361 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 
314 aa  54.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  36.17 
 
 
623 aa  53.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
162 aa  53.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
270 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.9 
 
 
837 aa  53.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.55 
 
 
784 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
275 aa  53.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  20.1 
 
 
833 aa  53.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
4489 aa  53.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 
988 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
270 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
207 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.14 
 
 
554 aa  53.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
637 aa  53.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  19.88 
 
 
409 aa  53.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
265 aa  53.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
448 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>