21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43936 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43936  antiviral protein  100 
 
 
1413 aa  2904    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03014  translation repressor/antiviral protein Ski3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08810)  26.08 
 
 
1410 aa  459  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.690097 
 
 
-
 
NC_006686  CND01700  translation repressor, putative  23.65 
 
 
1496 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
878 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27846  predicted protein  22.79 
 
 
1353 aa  59.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659995  normal  0.572567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
602 aa  55.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
466 aa  55.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.51 
 
 
810 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
833 aa  49.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
332 aa  48.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
409 aa  48.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
1297 aa  48.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
105 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.95 
 
 
927 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.67 
 
 
832 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
465 aa  46.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
409 aa  46.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
409 aa  45.8  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
634 aa  46.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
375 aa  45.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 
475 aa  45.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>