84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5280 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  39.37 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  39.89 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  38.96 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  37.7 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  37.7 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  37.81 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  38.42 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  38.46 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  38.15 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  37.87 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  36.58 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  37.43 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  37.87 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  36.58 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  36.32 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  36.86 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  35.68 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  33.83 
 
 		 475 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  31.16 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.07 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  32.7 
 
 		 477 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  34.02 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  34.7 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  37.79 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  34.79 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  32.27 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  35.22 
 
 		 348 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  32.19 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  35.01 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  31.62 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  39.32 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  29.52 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  29.1 
 
 		 560 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  35.66 
 
 		 360 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  35.66 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  29.76 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  31.67 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  31.88 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  31.39 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  32.23 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  27.01 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.79 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  27.18 
 
 		 593 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  26.06 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  26.81 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  26.11 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  37.71 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  37.64 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  22.84 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  28.95 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  26.92 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  22.8 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  23.36 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  22.38 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  22.09 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  36.03 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  25.89 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  24.17 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  22.65 
 
 		 499 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  24.36 
 
 		 513 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  25.89 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  26.69 
 
 		 549 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  26.69 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  31.2 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  23.06 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  33.56 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  26.8 
 
 		 635 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  22.7 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  32.48 
 
 		 372 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  34.33 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  31.93 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  23.93 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  22.25 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  25.42 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  22.6 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  35.29 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  21.54 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  32.69 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  24.32 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  24.55 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  26.64 
 
 		 569 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>