50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1424 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1139    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  30.6 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  28.97 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  28.53 
 
 		 380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.03 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  27.56 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  26.11 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  27.38 
 
 		 387 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  25.92 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  26.22 
 
 		 387 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  25.65 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  26.22 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  26.22 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  25.96 
 
 		 387 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  26.58 
 
 		 388 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  25.85 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  25.59 
 
 		 387 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  25.59 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  27.76 
 
 		 475 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  25.77 
 
 		 382 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  25 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  25.91 
 
 		 383 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  26.03 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  25.24 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  26.23 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  27.48 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  25.81 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  26.52 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  25.4 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  23.56 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  23.75 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  30.77 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  26.73 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  23.73 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  28.04 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  25.81 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  26.59 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  24.45 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  23.84 
 
 		 357 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  28.21 
 
 		 365 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  27.98 
 
 		 371 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  25.31 
 
 		 379 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  25.12 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  27.71 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  25.4 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  26.4 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0258  hypothetical protein  23.98 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  21.01 
 
 		 400 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  26.28 
 
 		 360 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>