13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4828 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  862    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  24.45 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  27.34 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  25.08 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  25.7 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.92 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  23.85 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  28.12 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  24.91 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  24.55 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  31.17 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>