51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0404 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  39.48 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  33.83 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  31.03 
 
 		 408 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  33.04 
 
 		 387 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  32.74 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  32.74 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  32.45 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  32.45 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  32.45 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  32.45 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.46 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  29.97 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.46 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  30.45 
 
 		 388 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  32.14 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  31.56 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  32.25 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  31.09 
 
 		 386 aa  133  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  30.73 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  30.18 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  30.25 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  30.97 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  25.13 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  29.28 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.05 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  31.67 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  29.35 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  27.62 
 
 		 560 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.74 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  34.8 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  25.31 
 
 		 386 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  31.54 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  31.85 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  29.04 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  29.05 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  29.48 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  26.1 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  29.2 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  27.73 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  32.26 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  24.75 
 
 		 347 aa  67  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  27.65 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  24.59 
 
 		 343 aa  57  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  24.48 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  23.69 
 
 		 343 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  28.12 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  23.53 
 
 		 572 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  27.04 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>