83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2395 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2395  porin  100 
 
 		 477 aa  962    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  32.7 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  27.23 
 
 		 464 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  30.6 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  30.24 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  31.44 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  30.68 
 
 		 387 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  28.95 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  28.46 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  29.75 
 
 		 418 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  28.85 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  27.2 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  27.25 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  26.2 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  28.46 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  26.1 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  28.18 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  28.18 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  28.18 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  28.18 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  26.37 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  28.02 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  27.72 
 
 		 383 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  29.26 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  28.85 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  27.39 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  25.85 
 
 		 400 aa  90.9  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  27.37 
 
 		 351 aa  87  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  25.28 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  26.16 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  24.6 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  23.88 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  25.65 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  26.08 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  27.27 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  25.13 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  24.44 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  28.49 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  26.49 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  25.89 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  26.55 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  26.17 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  26.18 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  26.18 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  23.44 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  22.92 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  22.04 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  24.51 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  26.91 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  22.6 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  25.26 
 
 		 386 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  22.68 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  23.67 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  24.59 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  24.01 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.64 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  21.15 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  24.28 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  21.93 
 
 		 484 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  22.9 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  20.19 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  22.43 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  22.3 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  22.52 
 
 		 513 aa  50.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  21.4 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  32.58 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  23.46 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  21.08 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  22.5 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  23.1 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  32.74 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  26.61 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  29.27 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  39.51 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  39.51 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  39.51 
 
 		 553 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  23.81 
 
 		 522 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  29.21 
 
 		 521 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  31.96 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  31.03 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>