54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2728 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1530  porin  84.47 
 
 		 380 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  100 
 
 		 379 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  85.49 
 
 		 387 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  88.95 
 
 		 380 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  76.55 
 
 		 386 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  71.83 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  72.09 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  71.83 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  72.32 
 
 		 383 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  70.8 
 
 		 387 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  71.06 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  71.06 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  70.54 
 
 		 387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  71.2 
 
 		 382 aa  567  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  47.16 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  50 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  38.77 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  37.7 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  34.96 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  35.47 
 
 		 475 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  35.84 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.16 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  36.18 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  34.69 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  36.81 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  35.92 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  34.72 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  36.15 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  33.59 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  34.36 
 
 		 346 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  33.12 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  29.18 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  29.8 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  31.55 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  30.35 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  32.25 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  30.31 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  29.08 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.1 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  28.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.92 
 
 		 560 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.93 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.32 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  28.18 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  27.49 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  24.77 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  26.67 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  25 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  30.67 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  27.71 
 
 		 585 aa  46.2  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  24.91 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  26.52 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  30 
 
 		 635 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>