52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2561 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2561  porin  100 
 
 		 386 aa  794    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  78.04 
 
 		 380 aa  624  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  76.55 
 
 		 379 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  78.98 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  75.26 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  70.26 
 
 		 387 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  70.26 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  70 
 
 		 387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  69.23 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  68.97 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  69.23 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  69.95 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  68.72 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  68.38 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  46.58 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  47.57 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  37.35 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  35.68 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  35.58 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  34.22 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  33.77 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  35.33 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  33.85 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  33.07 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  33.59 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  34.64 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  33.07 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  33.93 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  28.68 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  28.68 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  32.13 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  30.15 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  30.17 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  31.09 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  28.92 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.2 
 
 		 477 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  30.89 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  26.57 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25 
 
 		 560 aa  96.3  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  27.76 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  26.57 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  27.76 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  24.21 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.14 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.04 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  25.77 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  23.6 
 
 		 433 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  29.27 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  30.07 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  23.11 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>