41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0104 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  715    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  42.98 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  42.13 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  27.03 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  27.72 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  26.74 
 
 
382 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  27.49 
 
 
379 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  27.63 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  27.65 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  26.61 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  24.8 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  24.14 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  24.47 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  26.63 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  24.93 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  24.64 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  25.43 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  26.42 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  26.55 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  24.64 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  25.43 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  25.43 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  25.14 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  26.03 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  25.99 
 
 
408 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  25.96 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.92 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  26.32 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  24.92 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  27.21 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  26.03 
 
 
371 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  26.2 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  26.64 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  23.78 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  25.36 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.64 
 
 
477 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  24.93 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  26.01 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  25.57 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  24.58 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  40.74 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>