54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1263 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  76.59 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  63.53 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  57.35 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  56.59 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  52.71 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  48.07 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  47.51 
 
 		 356 aa  325  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  42.98 
 
 		 360 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  42.4 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  42.48 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  41.92 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  42.14 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  42.28 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  37.5 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  35.75 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  35.75 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  35.47 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  36.78 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  37.71 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  37.36 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  35.73 
 
 		 387 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  37.09 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  37.09 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  37.02 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  33.51 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  35.23 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  34.79 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  34.36 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  33.68 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  32.81 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  30.89 
 
 		 475 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  28.29 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  32.17 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  32.68 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  33.86 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.65 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  34.8 
 
 		 475 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.25 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  29.53 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  27.48 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  25.65 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.63 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.56 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  29.35 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  31.94 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  27.42 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  30.4 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  26.14 
 
 		 635 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  31.47 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  32.86 
 
 		 441 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  27.68 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>