51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0322 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  69.03 
 
 
357 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  65.27 
 
 
354 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  64.19 
 
 
360 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  62.73 
 
 
371 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  62.53 
 
 
360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  42.66 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  44.21 
 
 
346 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  42.4 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  42.9 
 
 
352 aa  272  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  42.48 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  42.65 
 
 
351 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  36.96 
 
 
344 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  36.2 
 
 
356 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  37.21 
 
 
383 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  31.79 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  34.47 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  34.36 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  31.98 
 
 
380 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  34.05 
 
 
387 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  34 
 
 
387 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  30.92 
 
 
387 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  34.33 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  34.33 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  34.33 
 
 
387 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  33.14 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  33.12 
 
 
379 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  31.69 
 
 
387 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  33.11 
 
 
380 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  30.15 
 
 
386 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  29.95 
 
 
475 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  31.39 
 
 
390 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  30.24 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  30.09 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  28.74 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  32.65 
 
 
470 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  31.85 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  25.13 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  32.26 
 
 
475 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  27.24 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  27.68 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.8 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  26.92 
 
 
593 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.81 
 
 
560 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.01 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  23.56 
 
 
386 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  27.16 
 
 
464 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  33.61 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  34.86 
 
 
549 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  26.97 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  26.47 
 
 
635 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.710875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>