58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1465 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  781    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  76.49 
 
 		 387 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  76.23 
 
 		 387 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  75.97 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  76.23 
 
 		 387 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  76.49 
 
 		 387 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  76.49 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  75.97 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  73.18 
 
 		 380 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  75.14 
 
 		 380 aa  584  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  72.32 
 
 		 379 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  70.23 
 
 		 387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  73.83 
 
 		 382 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  69.95 
 
 		 386 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  48.17 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  48.62 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  39.89 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  36.39 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  36.67 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  34.95 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  33.42 
 
 		 475 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.69 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  36.57 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  36.95 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  36.96 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  35.71 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  37.6 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  36.92 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  35.44 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  37.02 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  37.29 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  37.21 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  33.24 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.7 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  33.14 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  33.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  29.67 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  30.25 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  29.92 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  27.72 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.01 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  29.24 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.91 
 
 		 560 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  28.71 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  29.16 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  28.3 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.47 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  26.69 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  25.29 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  27.64 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  25.51 
 
 		 635 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  21.98 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  24.82 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  26.82 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  22.56 
 
 		 553 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  25.79 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  27.87 
 
 		 585 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  26.42 
 
 		 572 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>