31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1077 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1133    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  46.64 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  43.01 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  33.73 
 
 		 585 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  35.62 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  33.62 
 
 		 593 aa  233  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  33.56 
 
 		 635 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  27.04 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  27.04 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  25.94 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  27.04 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  27.24 
 
 		 383 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.47 
 
 		 470 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  28.85 
 
 		 380 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  27.67 
 
 		 380 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  25.44 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  27.27 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  28.15 
 
 		 387 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  27.08 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  28.63 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  27.92 
 
 		 387 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  25.46 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.61 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  27.61 
 
 		 382 aa  50.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  25.86 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  23.37 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  23.86 
 
 		 346 aa  47.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  22.3 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  24.29 
 
 		 452 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  25.66 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  26.5 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>