37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0557 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  71.91 
 
 
468 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  65.85 
 
 
444 aa  611  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  55.32 
 
 
450 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  27.12 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0037  hypothetical protein  27.94 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.434886  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1535  hypothetical protein  26.19 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1440  hypothetical protein  24.87 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0035  hypothetical protein  24.81 
 
 
425 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2423  hypothetical protein  24.69 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0051  hypothetical protein  23.53 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0039  hypothetical protein  23.79 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0519  hypothetical protein  21.57 
 
 
498 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0828452  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  26.16 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  23.15 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  23.15 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  23.42 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  22.65 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  29.27 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  24.94 
 
 
347 aa  50.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  23.38 
 
 
441 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  23.38 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  26.26 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.89 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  25.45 
 
 
387 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  25.36 
 
 
387 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  26.67 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  28.12 
 
 
549 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  24.52 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  25.36 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  24.34 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  24.31 
 
 
346 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  34.09 
 
 
572 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  27.35 
 
 
551 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  25.07 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  26.32 
 
 
569 aa  43.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.174396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>