18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2148 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  903    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  79.37 
 
 		 448 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  61.99 
 
 		 448 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  61.01 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  59.69 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  60.31 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0519  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0828452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  24.19 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  22.3 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  22.97 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  28.99 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  28.8 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  26.09 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  23.13 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  34.56 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  32.45 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>