57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1730 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  28.06 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  28.06 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  27.81 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  29.67 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  27.27 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  29.73 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  29.18 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  27 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  29.51 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  33.7 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  27 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  27 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  30.03 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  33.92 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  29.08 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  29.76 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  27.42 
 
 		 475 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  28.95 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  35.06 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  28.06 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  26.7 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  35.92 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  29.72 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  32.03 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  28.53 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.43 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  27.13 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  30.61 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  30.28 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  27.17 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  31.85 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  29.39 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  30.21 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  28.99 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  28.34 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  23.88 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  23.78 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  26.1 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  26.67 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  24.57 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  26.07 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  26.82 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  37.04 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  25.65 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  23.87 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  30.81 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  32.23 
 
 		 441 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  28.21 
 
 		 560 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  28.41 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  31.2 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  26.45 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  26.74 
 
 		 593 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  30.72 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  31.79 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  31.17 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>