29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1428 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  93.65 
 
 		 441 aa  853    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  898    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  65.85 
 
 		 452 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  63.84 
 
 		 448 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  63.33 
 
 		 448 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  61.92 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  38.86 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  30.9 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  25.6 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  28.25 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  32.35 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  31.08 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  30.81 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  28.8 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  33.52 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  25.93 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  29 
 
 		 549 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  28.35 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  29.55 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  27.27 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  23.38 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  32.89 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  32.74 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  31.11 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  32.45 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  29.46 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  31.47 
 
 		 346 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  27.6 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  27.14 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>